PGS.TS Nguyễn Trường Sơn đã có có 4 lần đảm nhiệm Trưởng Bộ phận thường trực đặc biệt chống dịch Covid-19 của Bộ Y tế tại Đà Nẵng, Bắc Giang - Bắc Ninh, TP.HCM (2 lần). Ông đã trực tiếp chỉ đạo công tác phòng chống dịch, đặc biệt trong những tình huống cam go nhất
Trước việc liên tiếp xuất hiện thêm nhiều biến thể mới BA.4, BA.5, BA.2.75, Thứ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Trường Sơn khẳng định, dịch Covid-19 là một tiền lệ chưa từng có và chưa kết thúc, đặc biệt có chiều hướng ngày một phức tạp.
Ngày 22/10, đoàn công tác của Bộ Y tế làm việc với Sở Y tế TP.HCM về công tác thu dung, điều trị bệnh nhân Covid-19 trên địa bàn thành phố đến cuối năm.
Làm việc với một số cơ sở điều trị Covid-19 ngày 22/9, ông Nguyễn Trường Sơn - Thứ trưởng, Trưởng Bộ phận thường trực đặc biệt của Bộ Y tế tại TP.HCM nhận định: Số ca mắc bắt đầu giảm, số ca tử vong có dấu hiệu đi xuống, đã thấy "ánh sáng cuối đường hầm" trong công tác phòng chống dịch ở TP.HCM.
Thứ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Trường Sơn đề nghị TP.HCM xem xét, có thể xây dựng "ngân hàng máu sống" ngay tại tuyến huyện để chủ động trong công tác chữa trị bệnh nhân Covid-19, chủ động đối phó với kịch bản có nhiều ca F0 trong thời gian tới.
Chiều 9/9, TP.HCM tổ chức họp báo định kỳ cung cấp thông tin về tình hình dịch Covid-19 tại TP, lần đầu tiên có sự tham dự của Thứ trưởng Bộ Y tế Nguyễn Trường Sơn, Trưởng bộ phận đặc biệt của Bộ Y tế về phòng chống dịch Covid-19 tại TP.HCM.